Centar za Ekologiju i TehnoEkonomiku (CETE) je najmlađa organizaciona jedinica IHTM-a i predstavlja naučnoistraživačku i razvojnu organizaciju koja obavlja primenjena istraživanja u oblasti zaštite životne sredine, održivog korišćenja prirodnih resursa, ublažavanja efekata klimatskih promena, kao i tehnoekonomske analize proizvodnih procesa i usluga.
Centar za Ekologiju i TehnoEkonomiku ima 11 zaposlenih istraživača od kojih su 8 u zvanju doktora nauka i troje studenti doktorskih studija.
Primenjujući savremene instrumentalne i laboratorijske tehnike, kao i inženjerske alate, zaposleni u Centru za Ekologiju i TehnoEkonomiku obavljaju primenjena istraživanja u oblasti zaštite voda, vazduha i zemljista, primene obnovljivih resursa i ekomaterijala, kao i razmatranje tehnoekonomskih i ekoloških aspekta prozvodnih tehnologija.
Centar za Ekologiju i TehnoEkonomiku učestvuje sa srodnim fakultetima i institutima u obrazovanju (izrada master i doktorskih teza) i usavršavanju naučnoistraživačkog kadra, a kroz redovno i aktivno učešće na naučno-stručnim projektima i međunarodnim konferencijama, kao i niza objavljenih publikacija u prestižnim međunarodnim časopisima, posebnim izdanjima (monografije, poglavlja u knjigama), značajno doprinosi razvoju naučnoistraživačke delatnosti i tehnološkom razvoju u Republici Srbiji.